Cell line	Transcriptomic subgroup	Doxorubicin	Entinostat	Alvespimycin	Tanespimycin	Bortezomib	Selumetinib	Trametinib	Linsitinib	Dasatinib	Nutlin-3	Navitoclax	Tivantinib	Rapamycin	PF-04691502	Paclitaxel	Vinblastine	JNJ-38877605	PHA-665752	BLU-9931	Brivanib	Regorafenib	Refametinib	ICG-001	Decitabine	Sorafenib	Sorafenib_MK-2206	MK-2206	Resminostat	Sorafenib_Resminostat	Alisertib	CD532	Lenvatinib	Cabozantinib	Sorafenib_Trametinib	Sorafenib_Refametinib
Huh7	CL1	0.63	0.99	0.51	0.57	0.55	0.96	0.8	0.99	0.82	0.97	0.96	0.69	0.55	0.6	0.32	0.44	0.95	0.92	0.74	0.96	0.91	0.9	0.96	0.87	0.94	0.79	0.84	0.85	0.83	0.61	0.63	0.82	0.87	0.70	NA
SNU739	CL3	0.82	1.09	0.69	0.94	0.26	0.89	0.86	0.83	0.71	0.94	0.99	0.7	0.79	0.79	0.29	0.47	1.01	0.88	0.96	1.01	1	1.04	1	0.96	0.98	0.9	0.96	0.9	0.81	0.64	0.7	0.98	0.98	0.89	0.95
Hep3B	CL1	0.55	1.12	0.61	0.78	0.31	0.9	0.5	0.92	0.84	0.89	0.81	0.83	0.74	0.6	0.52	0.67	0.99	0.89	0.78	0.94	0.99	0.82	0.94	1.04	0.93	0.87	0.93	0.99	0.96	0.75	0.7	0.92	0.95	0.59	0.80
Huh6	CL1	0.6	0.85	0.61	0.83	0.39	0.98	0.85	0.85	0.59	0.93	0.89	0.7	0.8	0.68	0.24	0.35	1	0.95	0.82	1.01	1.06	0.92	1	1.01	0.91	0.9	0.91	0.91	0.78	0.98	0.94	0.95	0.86	0.70	0.80
HepG2	CL1	0.81	0.97	0.36	0.45	0.47	0.75	0.5	0.85	0.76	0.9	0.95	1.09	0.79	0.92	0.56	0.76	1.01	0.85	1	0.99	1	0.57	0.93	1.02	0.87	0.88	1.04	0.99	0.94	0.95	0.65	1.04	0.93	0.37	0.53
HepaRG	CL2	0.56	0.9	0.71	0.76	0.25	0.73	0.29	0.87	0.49	0.99	0.56	0.59	0.81	0.63	0.3	0.46	1	0.87	0.94	1.01	1.06	0.74	0.98	1.01	1	0.86	0.81	0.88	0.91	0.83	0.73	0.94	0.93	0.35	0.61
HLE	CL3	0.73	0.93	0.57	0.65	0.24	1.04	1.16	1	0.89	0.98	0.94	0.61	0.73	0.68	0.42	0.39	1.04	0.92	0.89	1	1.05	1.09	1	0.98	0.86	0.81	0.91	0.87	0.81	0.68	0.62	1.02	1.04	0.97	0.99
HLF	CL3	0.73	0.99	0.55	0.63	0.3	1	1.1	1.05	0.93	0.98	0.97	0.74	0.86	0.84	0.39	0.41	0.99	0.94	0.96	1.01	1	1.08	0.99	1	0.97	0.9	0.96	0.89	0.84	0.73	0.71	1.03	1.00	1.01	1.00
SNU182	CL3	0.57	0.89	0.75	0.9	0.64	0.97	0.92	0.96	0.68	1.02	0.98	0.87	0.83	0.81	0.55	0.43	1.04	0.98	0.99	1.05	0.99	0.89	0.93	0.99	0.92	0.81	0.88	0.93	0.86	0.94	0.77	1.05	0.94	0.81	0.87
SNU387	CL3	0.72	0.99	0.63	0.83	0.37	0.87	0.85	0.92	0.78	0.97	0.92	0.78	0.78	0.73	0.56	0.65	0.97	0.93	0.9	1.03	1.01	0.83	0.94	0.98	0.96	0.86	0.87	1	0.91	0.9	0.76	1.01	0.90	0.52	0.71
SNU398	CL3	0.6	0.92	0.64	0.67	0.54	0.97	0.75	0.9	0.99	0.89	0.78	0.72	0.42	0.62	0.29	0.37	1.11	0.85	0.99	1.05	1.02	0.91	0.98	0.91	0.91	0.94	1.01	1.02	0.88	0.68	0.64	0.85	0.84	0.69	0.72
SNU423	CL3	0.57	0.97	0.76	0.87	0.41	0.91	0.82	0.84	0.7	0.99	0.82	0.71	0.72	0.65	0.31	0.43	0.96	0.89	0.93	1.03	1.02	0.95	0.96	0.94	1	0.88	0.89	0.88	0.84	0.78	0.75	1.01	0.96	0.72	0.84
SNU449	CL3	0.86	1.07	0.82	0.87	0.37	1.05	1	0.95	0.91	1	1.02	0.84	0.89	0.7	0.75	0.73	1	0.99	0.99	1.04	1.04	0.98	1.02	0.93	0.94	0.88	0.96	1.02	0.92	0.95	0.87	1.02	0.97	0.82	0.89
SNU475	CL3	0.95	1.01	0.58	0.8	0.43	1.02	0.94	0.95	0.8	0.91	0.84	0.75	0.7	0.72	0.63	0.66	1	0.93	0.95	1.08	1.06	1.01	1	1.01	1.05	0.93	0.99	0.97	0.93	0.97	0.82	0.96	0.87	0.85	0.88
PLC/PRF5	CL1	0.73	0.87	0.44	0.53	0.42	0.82	0.79	0.93	0.81	0.97	0.9	0.79	0.59	0.6	0.37	0.49	0.95	0.87	0.93	1.03	1.03	0.97	0.92	0.98	1.04	0.85	0.92	0.93	0.94	0.87	0.83	1.06	0.98	0.86	0.91
Mahlavu	CL3	0.66	0.9	0.67	0.78	0.14	0.88	0.9	0.98	0.77	1	0.9	0.82	0.72	0.67	0.3	0.41	1.02	0.9	0.97	1.05	1.04	1.01	1.01	0.94	0.96	0.91	0.8	0.91	0.88	0.8	0.71	0.98	1.01	0.85	0.94
Li7	CL2	0.71	0.83	0.63	0.7	0.64	1	0.66	1	0.66	1.1	0.7	1.07	0.44	0.44	0.66	0.65	1.03	0.94	0.98	0.98	0.88	0.98	0.96	1	0.84	0.9	0.99	0.86	0.7	0.88	0.71	1.08	0.95	0.75	0.83
HCC-3	CL1	0.55	0.85	0.66	0.79	0.27	0.89	0.83	0.79	0.88	0.93	0.78	0.77	0.7	0.61	0.68	0.73	0.81	0.77	0.99	1.01	1.03	0.94	0.94	1.01	0.9	0.77	0.86	0.95	0.89	0.85	0.78	0.96	0.68	0.69	0.79
B1	CL1	0.78	0.66	0.7	0.81	0.16	0.94	0.84	0.57	0.69	0.89	0.71	0.75	0.51	0.6	0.33	0.52	1.02	0.91	0.85	1.03	1.05	1.06	1.02	1.04	0.78	0.68	0.79	0.95	0.68	0.68	0.82	0.86	0.71	0.30	0.77
HCC-1.1	CL3	0.67	0.81	0.47	0.58	0.22	0.96	0.69	0.93	0.74	0.96	0.86	0.51	0.65	0.63	0.36	0.27	0.96	0.89	0.85	1.03	1.13	0.94	1	1.05	0.96	0.77	0.81	0.91	0.85	0.58	0.76	1.08	0.95	0.73	0.87
HCC-1.2	CL1	0.68	0.86	0.48	0.59	0.33	0.88	0.45	0.87	0.63	0.87	0.7	0.71	0.64	0.57	0.31	0.39	0.96	0.9	0.84	1.01	0.97	0.78	1	0.93	0.86	0.79	0.81	0.84	0.81	0.84	0.82	0.95	0.93	0.41	0.68
Huh1	CL1	0.78	0.84	0.56	0.62	0.46	1	1.08	0.83	0.86	0.95	0.91	0.85	0.91	0.69	0.47	0.58	0.81	0.77	0.96	1.08	1.05	1	0.98	1	0.98	0.77	0.81	0.84	0.83	0.88	0.64	1.05	0.92	0.94	0.87
JHH1	Unclassified	0.98	1.03	0.75	0.82	0.22	0.64	0.37	0.84	0.42	1	0.88	0.88	0.7	0.58	0.54	0.53	1.04	0.96	0.96	1.03	1.03	0.67	0.94	1	1.07	0.74	0.74	0.72	0.8	0.77	0.65	1.01	1.00	0.42	0.63
JHH2	CL2	0.73	1.15	1.1	1.01	0.55	1	0.89	0.91	0.83	0.99	0.93	0.96	0.66	0.69	0.69	0.56	1.05	0.93	1	1.01	1.05	0.94	0.97	0.98	1.04	0.89	0.92	0.92	0.87	0.94	0.91	1.01	0.99	0.61	0.74
JHH4	CL3	0.59	0.93	0.78	0.88	0.4	1.06	0.92	1.1	0.6	1	0.95	0.63	0.75	0.54	0.47	0.46	1.01	0.94	0.92	1.03	1.06	1	0.99	1	0.95	0.87	0.94	1.02	0.89	0.72	0.86	0.88	0.83	0.74	0.89
JHH5	CL1	0.72	0.82	0.4	0.41	0.35	0.81	0.4	0.66	0.75	0.98	0.88	0.66	0.58	0.68	0.36	0.52	0.83	0.77	0.99	1.03	0.98	0.78	0.99	0.97	0.82	0.63	0.76	0.83	0.69	0.71	0.64	1.09	0.84	0.35	0.62
JHH6	CL3	0.69	0.95	0.72	0.73	0.52	1	0.92	0.9	0.82	0.96	0.91	0.7	0.83	0.71	0.4	0.55	0.98	0.88	0.94	1.03	1	1.12	1.02	1	0.95	0.82	0.88	0.93	0.88	0.8	0.61	0.96	0.96	0.92	0.94
JHH7	CL1	0.67	0.94	0.56	0.59	0.38	0.9	0.76	0.87	0.83	1	0.89	0.65	0.66	0.68	0.3	0.39	0.96	0.88	0.79	0.99	1	0.92	0.96	1.01	0.91	0.74	0.88	0.84	0.71	0.72	0.68	0.96	0.95	0.72	0.82
SNU354	CL2	0.87	0.89	0.65	0.7	0.27	0.99	0.84	0.95	0.7	1	0.83	0.75	0.75	0.67	0.52	0.6	1.04	0.93	1.03	1.09	0.97	1	0.97	0.98	0.91	0.93	1.04	0.92	0.73	0.88	0.88	0.96	0.97	0.78	0.84
SNU368	CL2	0.89	0.99	0.65	0.73	0.55	0.92	0.89	0.87	0.76	0.91	0.95	0.8	0.87	0.73	0.77	0.78	0.96	0.88	1	1.03	1.03	0.96	0.94	0.94	0.92	0.81	0.83	0.9	0.9	0.91	0.77	1.06	0.97	0.84	0.91
SNU761	CL2	0.75	0.92	0.79	0.88	0.46	0.98	0.64	0.95	1	1.02	0.98	0.83	0.75	0.76	0.95	0.9	1.12	0.97	1.03	1.09	1.05	0.99	1.03	1	0.99	0.9	0.95	0.89	0.8	0.97	0.94	1.06	1.05	0.62	0.83
SNU878	CL2	0.78	0.93	0.76	0.67	0.37	0.75	0.45	1	0.7	0.86	0.56	0.56	0.63	0.58	0.46	0.42	0.98	0.91	0.91	1	1.1	0.93	1	0.99	1.06	1	1.02	0.98	0.91	0.72	0.81	1.05	1.06	NA	0.83
SNU886	CL2	0.65	0.94	0.61	0.78	0.39	1.05	0.74	0.98	0.74	1.02	0.8	0.64	0.55	0.53	0.36	0.34	1.02	0.96	1.07	1.04	1.01	0.88	1	0.99	0.96	0.92	0.98	0.95	0.9	0.86	0.77	0.98	1.01	0.43	0.75
MHCC97H	CL2	0.83	0.9	0.61	0.78	0.5	0.99	0.72	0.93	0.95	0.98	0.98	0.73	0.85	0.74	0.59	0.57	0.57	0.59	0.79	1.06	1.03	0.94	0.96	1	0.98	0.85	0.84	0.91	0.87	0.83	0.9	0.92	0.56	0.75	0.84